R2-P2

Analyse de données multi-modales pour les Pathologies complexes par la conception et l’implémentation de Protocoles Reproductibles et Réutilisables



Résumé
L’étude de pathologies telles les anévrismes intracrâniens nécessite l’utilisation d’une grande variété de données et la conception de protocoles d’analyse complexes. La diversité de leurs implémentations rend leur maintenance et partage difficile et limite la confiance des biologistes dans les données produites. Reproduire et réutiliser les protocoles est pourtant crucial pour comparer systématiquement les résultats biologiques, adapter des protocoles à de nouvelles problématiques et répondre aux exigences des plans de gestion de données. R2-P2 fournit (i) une large bibliothèque de protocoles organisés, (ii) un module de conception et d’exécution de protocoles reproductibles, réutilisables et citables (conception d’algorithmes d’indexation et de recherche efficace de motifs dans les graphes formés par les workflows implémentant les protocoles), (iii) une évaluation de l’approche sur de nouveaux jeux de données et (iv) un ensemble de critères FAIR pour les protocoles.

Mots-clés
Réutilisation et échange de protocoles, workflows scientifiques, Analyse de données multi-modales, Reproductibilité des résultats biologiques, protocoles FAIR

Partenaires du projet

INS2I
COHEN-BOULAKIA Sarah
(UMR8623) Orsay France
INSB
Gaignard Alban
Institut du Thorax (UMR6291) France
Lucie Biton. This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 2.0 France License
Crédit photo : Lucie Biton. This work is licensed under a Creative Commons Attribution-NonCommercial-NoDerivs 2.0 France License

Pour plus d’informations https://r2-p2.github.io/r2p2/