Deciph-G4 Décryptage du rôle et de la structure des G-quadruplexes dans le génome humain

Résumé

Les G4-quadruplexes (G4s) sont des structures secondaires alternatives à la forme B de l’ADN, très bien caractérisées in vitro. Des outils récents permettent également de prévoir les séquences formant ces structures dans les génomes et montrent qu’elles sont surreprésentées dans les séquences régulatrices humaines telles que les promoteurs. Le projet que nous proposons est basé sur l’utilisation de technologies innovantes développées par nos groupes de recherche et permettant de cartographier les G4s in vivo et de déterminer leur structure in vitro. L’un de nos objectifs est de mieux comprendre leur rôle dans la transcription. Nous proposons en particulier qu’ils forment des structures promotrices permettant l’ouverture de la chromatine par défaut et le recrutement de la machinerie de transcription en amont des gènes à transcrire (Figure). Dans ce projet, nous combinons les compétences d’un groupe spécialisé dans l’analyse du génome (JC Andrau, IGMM, Montpellier) et d’un groupe expert dans les techniques biophysiques de caractérisation structurale des G4s (Jean-Louis Mergny, LOB, Palaiseau). A terme, le projet que nous déployons et nos compétences conjointes nous permettront de mieux comprendre le mode d’action de ligands de G4s qui sont envisagés en thérapie pour des pathologies telles que le cancer.

Mots clés

Partenaires du projet

INSB

Jean-Christophe Andrau

Institut de Génétique Moléculaire (IGMM)

(UMR5535) Montpellier, France

INP

Jean-Louis Mergny

Laboratoire d’Optique et Biosciences

(UMR7645) Palaiseau, France

Les G-quadruplexes sont des éléments promoteurs dans les cellules mammifères. Modèle de travail basé sur des données obtenues par nos laboratoires, expliquant le rôle potentiel des G4s dans la transcription. Les G4s situés en amont du site de transcription permettent l’ouverture de chromatine en excluant les nucleosomes localement (rectangle gris). Cette zone accessible est en retour un site privilégié de recrutement de la machinerie de transcription qui pourra initier un ou plusieurs cycle de transcription.
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